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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-04-17 05:41:40, GGGenome : Mimulus guttatus genome, v2.0

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

scaffold_5:16352951-16352965
TTCGGATTCTTCTGTTGAATCATATTGTGT16352951TTCATTGACAACATTACGCTTGTTTTTGTTATTTTTAGTAGTCAA
scaffold_10:12703410-12703424
AACTTTTTGAACATTGTAGGTTTTATGATC12703410TTCATTGACAACATTATCACCCTTGATAGCAATTTTGAATAACAT
scaffold_416:14638-14652
AACTTTTTGAACATTATACGTTTTATGATC14638TTCATTGACAACATTATCAGCCTTGATAGCAATTTTGAATAACAT
scaffold_4:8570864-8570878
TTGATACTAAAAGTAACAAAAAACAACTAT8570864AATGTTGTCAATGAAACCCAACACAAGTCAACAAAAAAAAATCCA
scaffold_4:13716651-13716665
TTGACAATTAAATATAACAAAAACAACCGC13716651AATGTTGTCAATGAAACTCAACACGATTCAACAAAAAAGAATCCA
scaffold_11:11614173-11614187
AATGTTATTCAAATTGCTATCAAGGGTGAT11614173AATGTTGTCAATGAAGATCATAAAACGTACAATGTTCAAAAAGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Mguttatus_v2.0/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Mguttatus_v2.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.74:28307/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.087 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.74:28307/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.089 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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