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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2024-03-29 22:31:56, GGGenome : D. yakuba genome, WUGSC 7.1/droYak2 (Nov, 2005)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

chr3L:18657322-18657336
CGCGACGTGGACGGGCAGGATGTGCTGCTC18657322TTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACGCAGGCGGGATCGGAAGTG
chr3L_random:2648390-2648404
CGCGACGTGGACGGGCAGGATGTGCTGCTC2648390TTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCGGGATCGGAAGTG
chr3R:24637540-24637554
CGCGACCCAGTCTTCTACAAGTGGCACGCG24637540TTCATTGACAACATTTTCCAGGAGCACAAGGGGCGACTTCCGGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/droYak2/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : droYak2 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.124 | 0.116 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28106/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.128 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28106/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.128 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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