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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-01 12:36:17, GGGenome : Leersia perrieri genome, Lperr_V1.4 (Mar, 2014)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

5 dna:chromosome chromosome:Lperr_V1.4:5:1:20807039:1
position: 5923116-5923130
TATGATTGAGCACTCCTACCTACTTTGCAA5923116AATGTTGTCAATGAACTGTTTGTTCGCTGCATAAATGTTCAATGA
5 dna:chromosome chromosome:Lperr_V1.4:5:1:20807039:1
position: 18768258-18768272
TCCTTCATAAATTACCTGAGTGAAACGGAA18768258AATGTTGTCAATGAACAGAAGCACATCTTGTCCTTCAGCATCACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Lperr_V1.4/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : Lperr_V1.4 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.081 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28178/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.086 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28178/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.086 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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