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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 18:49:41, GGGenome : Xenopus tropicalis genome, XenBase/JGI 7.1

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

scaffold_1:
179364307-179364321
ATAGGGTTCAGTTATGACTGCAACTGTGCG179364307TTCATTGACAACATTTATCCAGGTTTCTTCTGTGCAAATCGCTCC
scaffold_2:
108736489-108736503
AGGGAGTGGTGTGTGGAACTGGTATTCCAG108736489TTCATTGACAACATTACCTTGAAATAAATGGGGTTTGGAGGCAGA
scaffold_7:
76181911-76181925
ACGGGCATCTGAAAATGTGAAAATACCACA76181911TTCATTGACAACATTGTATTGAGAAGTTTATAAAATAATGTGAAG
scaffold_45:
419397-419411
CACTCTCACAATATTCAATATTTTGGTTGC419397TTCATTGACAACATTATTCTTATATGGTCCGGTACCGATGAACAA
scaffold_4:
66453287-66453301
CCAATAGCTTTGGGAATGAGCAGTGTAAGC66453287AATGTTGTCAATGAAACAAAATTATACAGGCCAATAACTTATTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Xentr7/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Xentr7 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
0.089 | 0.079 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28225/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.095 | 0.006 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28225/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.095 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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