GGGenome | Results

2024-11-23 22:47:49, GGGenome : Oryza sativa Indica genome, ASM465v1 (Jan, 2005)

Summary:

Results:

2 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:2:1:38103930:1
position: 33044774-33044788

GAGCAAGCCATGAATCGGTACAAACAAGAG33044774AATGTTGTCAATGAACAGGTCTTATCCACACGTCGGACATCAGGA

5 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:5:1:31240961:1
position: 9528623-9528637

TATGATTGAGCACCCCTACCTACTTTGCAA9528623AATGTTGTCAATGAACTGTTTGTTCGCTACATAAATGTTCAATGA

5 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:5:1:31240961:1
position: 28795206-28795220

TCTTGCATAAATTACCTGAGTGAAACGGAA28795206AATGTTGTCAATGAACAAAAGCACATCTTGTCCTTCGGCATCACG

10 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:10:1:22204031:1
position: 3787614-3787628

CCCCTCCATAAGCAGCCTCTTTTCCCTATC3787614AATGTTGTCAATGAATGTTTTAGGCAGCTGCAAAGTGCACATGTA

3 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:3:1:41884883:1
position: 10549386-10549400

TGATCCCAATAGTTGTTTATTTTTGGACTC10549386TTCATTGACAACATTGCCACTTTGATGACTGTTCTGACATGAATG

7 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:7:1:27957088:1
position: 11845904-11845918

CGTGTGCCTCCTGGATGCACCAATCGGCTG11845904TTCATTGACAACATTTTGTTGAAGGACCTTGGCAACATCTTTTTG

7 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:7:1:27957088:1
position: 22396635-22396649

AGATCTATCTAATTTAGGTGTAGTGCTCTC22396635TTCATTGACAACATTTTTCACTTCCTGCGTTAGGTTTCCATTATC

9 dna:chromosome chromosome:ASM465v1:9:1:21757032:1
position: 14677856-14677870

CTTTCAAATGATGGTCAAACTAATTATAAA14677856TTCATTGACAACATTAACTAAACGAGTGAAGAGTGAAGAGAAGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

タブ区切りテキスト → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトに直接コピペできます。
CSV形式 → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトにて開くことができます。
BED形式 → リンク | ダウンロード
GFF形式 → リンク | ダウンロード
JSON形式 → リンク | ダウンロード

Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28190/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.087 | 0.006 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28190/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.090 | 0.003 | cgi_end;