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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-05-05 16:07:03, GGGenome : Acyrthosiphon pisum genome, Acyr_2.0 (Jun, 2010)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GL349956 dna:supercontig supercontig:GCA_000142985.2:GL349956:1:391721:1
position: 90551-90565
TGAGAAAATTTAAGATTTTAATGGACACTG90551TTCATTGACAACATTGTCTTAGCACTCAACTACAAAAAATATTAA
GL351037 dna:supercontig supercontig:GCA_000142985.2:GL351037:1:141165:1
position: 105930-105944
GTCATCGCATTTTAAAACGCATTGTTTTAA105930AATGTTGTCAATGAAGTGCTAATATTTTAAACATGTGTGTTTCTA
GL350052 dna:supercontig supercontig:GCA_000142985.2:GL350052:1:193683:1
position: 111903-111917
GTACTTAGTTAAATAATAAATATACATACT111903AATGTTGTCAATGAACAATAGTATGTAGGTACATTACATTACTGC
GL349862 dna:supercontig supercontig:GCA_000142985.2:GL349862:1:741136:1
position: 411418-411432
TATACATATATTATTATATATTCCATAATA411418AATGTTGTCAATGAACCTTATGCTCACACATAAGATTATAAACAG
GL349904 dna:supercontig supercontig:GCA_000142985.2:GL349904:1:980720:1
position: 298294-298308
TGATAAAGAACTAAGTACATATATTTTTTA298294AATGTTGTCAATGAATAGAAGATATTAGTTCTACTTCTATGTCCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Acyr_2.0/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Acyr_2.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28131/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.088 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28131/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.091 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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