# [ GGGenome | 2024-12-29 22:56:55 ] # database: Atta cephalotes genome, Attacep1.0 (Jul, 2012) # query: AATGTTGTCAATGAA # count: 6 # query: TTCATTGACAACATT # count: 17 # name strand start end snippet snippet_pos snippet_end query sbjct align edit match mis del ins scaffold00065 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00065:1:1202458:1 + 910148 910162 TGATAGCGATAGAATCTCATATACACTGTTAAAAAAACAGAACTTTGCTTTCGTTATATGTAATGGAAGCAAATTTCAAGCAGATACATTAAAAATATTTAATGTTGTCAATGAAAATGAAGTTACAAGTAACTTAAATTTAACGTTTACATTAAATTTTATACAAATCTACATAAAATTTAATAAAAAATGTACTAAACTTCATAAAATTTTAT 910048 910262 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00058 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00058:1:1577302:1 + 334550 334564 GTTAAATCATTACTTTTAATTTCGTTCATAACCATGAGCTTCATTTACATGTAAAGGAAACTCGTGGTTACATTTCTAACAATGTACATTAAAAATATTTAATGTTGTCAATGAAAATGAAGTTATAAATAACTTAAATTTAACGTTTACTTGCATTAAATTTCATGAAAATCTACATTAAATTTTATGAAAAGTACGCTAAATTTCACAAATGT 334450 334664 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00055 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00055:1:1662402:1 + 905556 905570 AAGCACTCTAAAAAATCAGTACACACTGTTAAAAAAACAGAAATTTGCCTCCGTTACATGTAATGGAAACAAATTTCAAGTAGGTATATTAAAAATATTTAATGTTGTCAATGAAAATGAAGTTATAACTTAAATTTAAAGTTTACTTACATTAAATTTCATGCAAATTTACACAAAATTTAATAAAAAATGTACTAAATTTCATAAAATTTTAT 905456 905670 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00014 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00014:1:6127344:1 + 2051328 2051342 GAAAACGGCGGAAACAAAGTTGTATACCTAATAGAAAATTGTCTTATCATTTCCGTTATATAACGAAAGCAAATTTCAAACAGGTACATTAAAAATATTTAATGTTGTCAATGAAAATAAAGTTATAAGTAACATAAATTTAACATTTACTTATATTAAATTCCAAATCTACATAAAATTTAATAAAAAATGTATTACATTTCGTAAAATTTTAT 2051228 2051442 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00014 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00014:1:6127344:1 + 5624396 5624410 AAAATTGGATTCGAATAAAATGAGTTACACTGTTAAAAAAAGAGAAATTTGCTTCTGTTGTAATGGAAGCAAATTTCAAGTAAGTACATTAAAAATATTTAATGTTGTCAATGAAAATGGAGTTATAAGTAACGGAATTATAAATTTAATGTTTACTTATATTAAATTTCATGCAAATCTACATAAAATTTAATAAAAAATGTAAATTAAACTTC 5624296 5624510 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00001 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00001:1:15679321:1 + 15618565 15618579 CTGCTTTGCCTATTTGTAACGTACACTGTTAAAAAAATAGAAATTTATTTCCATTACATGTAATGGAAGCAAATTTCAAGCAGGTACGTTAAAAATATTTAATGTTGTCAATGAAAATAAAGTTATATAATAAGTAACTTAAATTTAATTTTACTTTATTAAATTTTACTTTATTAAATTTCATGTAAATCTATAATCTAAAATTTAATGAAAAA 15618465 15618679 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00988 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00988:1:3443:1 - 688 702 TTTGATTGTTATTATACATTAAAATATTTGTATATTGAAGTGCATGAAGTTTAAAATATATATATATATACGTTAAATTTAAGTTACATATAACTTCAATTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATATAAAAAATTTGCTTAAAATTTGCTTCTGTTGTATATACAAATGAAATTTAATGGATTTTTTTAACAGTGTATCACAGTGAAAAATG 588 802 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00080 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00080:1:727383:1 - 704973 704987 TACGAAGTTTAGTACATTTTTTATTAAATTTTATGTAGATTTGTATGAAATTTAATGTAAGTATTATAAATGTTAAATTTAAGTTACTTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATGTACTTGCTTAAAATTTACTTCATGTAACGGAAATAAATTTCTGTTTTTTTTAATAGTGTATTCCTATTTTTCTATTTCTATTTCCG 704873 705087 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00072 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00072:1:950923:1 - 119902 119916 TTTACGACGTTTAGTATATTTTTTTTATTAAATTTCATTTTAGATTTGCATGAAATTTAATATAAGTAAACGTTAAATTTAAGTTACTTATAATTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTAAATATTTTTAATGTACACTGTTAGAAATGTAACCACGAGCTTCCTTTACATGTAAATGAAACTCGTGGTTATGAGCGAAATTAAAAATAATG 119802 120016 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00062 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00062:1:1311589:1 - 1082220 1082234 ATTTTACAAAGTTTAGTACATTTTTCATTAAATTTTTATATAGATTTGCATGAAATTTAATGTAAGTAAACGTAAAATTTAAGTTACTTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATGTACCTTCTTGAAATTTGCTTCCATTATAGGTTAACGTAAGCAAATTTCTATTTTTTTAACAGTGTATAGTAAAAAATAGATGTAAA 1082120 1082334 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00050 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00050:1:2033351:1 - 1198093 1198107 AATTTTATGAAGTTTAGTATATTTTTCATTAAATTTTATACAGATTTGCATAAAATTTAATGTAAATAAACGTTACATTTAAGTTACTTATAACTTTATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTGACAACATTTTTAATATATCTGCTTGAAATTTGCTTCCATTACATATAACGGAAGCAAATTTCTGTTTTTTTAACAGTGTATAGTTTGATT 1197993 1198207 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00047 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00047:1:2221732:1 - 1575006 1575020 ACTTTCCATTAAATTTTCTTTTCTTTGTGAATATGAATAAAATTTATTACTGCATATGAATGCATTAAAGTTAAGTTACTTGTGTAAGTTACTTCATATTTTCATTGACAACATTTAAATATTTTTAATGTACCTGTTAGAAATTTGCTTCCGTTACATGTAATGGAAGCAAATTTTTTTTAACAATATACATTATTATTTTCGGTTAAAATATC 1574906 1575120 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00043 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00043:1:2330101:1 - 447667 447681 TTTACAAAGTAGTTTAGTACATTTTTTATTAAATTTTATGTAGATTTGCATGAAATTTAATATAAGTGAATGTTAAATTTAAATTACTTATAATTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATGTAAGTAACTGCTTGAAATTTGTTTCCATTATATGTAACGGAAGCAAATTTCTGTTTTTTTAACAGTGAAGCATATTTAATACTGTA 447567 447781 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00045 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00045:1:2402745:1 - 1767046 1767060 ATTTTTATCAAGTTTAGTACACTTTTTATTAAATTTTATGTAGATTTATATGAAATTTAATGTAAGTAAACATAAAATGTAAGTTACTTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATAAATTTATATTTTTAACGTACCTGCTTGAAATTTGCTTATTACATGTAACGGAAGCAAATTTCCTTTTTTTGTACAGTGTATCAAACATTATCGAA 1766946 1767160 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00040 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00040:1:2629504:1 - 481742 481756 ATTTTATAAAATTTAATACATTTTTTAATTAAAATTTTTGTAGATTTGCATGAAATTTAATGCAAGTAAACGTTAAATTTAAGTTACTTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATACCTGCTTGAAATTTGCTTTCATTATATATAACGGAAGACAAACTTCTTTCTTAACAGTATAGACACAATTATTGCTTTATTTAGCA 481642 481856 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00024 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00024:1:4810721:1 - 3968025 3968039 TTTAATTTGGTACATTTTCCATTAAATTCTATGTAAATTTGTATGAAATTTAATGTATGTGAACGTTAAATTTAAATTACTTATAAACTGTGTTGTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATACCTGCTTGAAATTTACTTCCATTATATATAACAGAAACAAATTTCTTTTTTTTAAGTGTAGGAGACACAGGCTGCATTCTATTATA 3967925 3968139 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00021 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00021:1:5154485:1 - 618518 618532 TTTACGAAGGTTTAGTACATTTTTTATTAAATTTTATATGAAATATTTTATGAAATTTAATATAAGTAAACGTTAAATTTAAGTTATTTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATGCATGAAATTTGTTTCCATTACATGTAACGGAAGCAAATTTCTTTTTTTTTTTAAGCTAGTGTAGAACACAGAGTCATAATTAAATC 618418 618632 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00015 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00015:1:5896156:1 - 5234040 5234054 ATAAAATTTTATGAAGTTTAGTACATTTTTTATTAAATTTTATATAGCTTTGCATGAAATTTAATATAAACGTTAAATTTAAGTTATTTACAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAGTATTTTTAACGTATTTGCTTGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 5233940 5234154 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00014 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00014:1:6127344:1 - 4425205 4425219 AAATTTTACTAAATTTAGTACATTTTTTATTAAATTTTATGTAGATTTGCATGAAATTTAATATAAGTAAATGTTAAAATTGAGTTTTTTATATTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATGTACCTGCTTGAAGAATTCCATTACATATAACAGAAACAAATTTCTTTTTTTTTAACAGCTATTTTTTATAGTTATTAATTTTATGT 4425105 4425319 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00014 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00014:1:6127344:1 - 4837477 4837491 ATAAAATTTTACAAAGTTTAGTTTTTTATTAAATTTTATGTAGATTTGCTTAAAATTTAATATAAATAAACGTTAAATTTAAGTTACTTATAATTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATTGAAATGTTTGCTTGAAATTTGCTTCCATTATATGTAACAGAATCAAATTTCTTTTTTTTTAACAGTATATAACAATTATATAGGAT 4837377 4837591 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00009 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00009:1:7121624:1 - 4196747 4196761 AAATTTTACGAAGTTTGGTATATTTTTTATTAAATTTTATGTAATTTGCATAAAATTTAATGTAAGTAAATGTTAAATTTAAGTTACTTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATATTTTTAATGTACCTGTTTGAAATTTGCTTCCATTACATGTAACGGAAGCAAATTTTTTTTTTAACAGTGTATAAAACATAAAGTAATTAATTACC 4196647 4196861 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00008 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00008:1:7313927:1 - 437863 437877 AAATTTTACAAGGTTTAGTACATTTTTTATCAAATTTTATGTAGATTTGCATAAAATTTAATATAAGTAAATGTTAAAATTAAGTTATTATAACTTCATTTTCATTGACAACATTAAATTTTTAATGTACCTGTTTGAAATTTCCATTACATGCAACGGAAGCAAATTCCTTTTTTTTTACAATGTAGAGTTAAAACTTAATGCACAAATTAACG 437763 437977 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 scaffold00001 dna:supercontig supercontig:GCA_000143395.2:scaffold00001:1:15679321:1 - 14966223 14966237 TTACATTAAATTTAAGTAACGTGTATTGAAATTTTGGTTACTATATTAAAATAATCGTCTATTGAAATTTAAAATATGTGAACTTACTTGTAATTTCAATTTCATTGACAACATTAAATGTTTTTAATGTAACTGCTTGAAATTTGTTTCCGTTACATGTACGTGAAATTTAATGTGGATTTTTTAAGTGTAGGTAGGTTGTTCATGTCCCAAGT 14966123 14966337 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0