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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2024-04-25 09:22:57, GGGenome : Leptolyngbya sp. Heron Island J genome, GCA_000482245.1

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

AWNH01000055:4177-4191
TGGCCCGATGAGTAAGCTTTGATGGAGATG4177AATGTTGTCAATGAATAGAGCTCTAGTTTTCTCAAGCTTTACAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/GCA_000482245.1/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : GCA_000482245.1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.080 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28498/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
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0.084 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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