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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2024-03-29 03:55:40, GGGenome : Curvularia geniculata W3 genome, ASM298223v1 (Mar, 2018)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

PQMW01000095.1 Curvularia geniculata strain W3 NODE_95_length_109432_cov_26.6063, whole genome shotgun sequence
position: 97961-97975
TTCCGAAACCAGGGACAGGATGTGTTGCTC97961TTCATTGACAACATTTTCCGGTATGTTTTTTGGCGGTAGAAGTGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/GCA_002982235.1/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : GCA_002982235.1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.152 | 0.143 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28849/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.155 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28849/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.156 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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