GGGenome | Results

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2025-03-13 18:44:03, GGGenome : Hordeum vulgare genome, 082214v1 (Mar, 2012)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

4 dna:chromosome chromosome:082214v1:4:1:544168226:1
position: 281534574-281534588

TGATGCACCGCTAAGTGTGCCACCCCCTCC281534574AATGTTGTCAATGAACATTTTGAATGTGTGGCAGGCATGGTCTGA

1 dna:chromosome chromosome:082214v1:1:1:464124043:1
position: 152251787-152251801

GCATCCAAATAGGCAGAAACTTAGGAGAAT152251787TTCATTGACAACATTGAAGAAAGGGATAGAGCTGGTTTTTAGTAT

3 dna:chromosome chromosome:082214v1:3:1:564427874:1
position: 15026981-15026995

CCCATAGTTTTTTAACAACAACATATTTTT15026981TTCATTGACAACATTTTACACAGAGTATTGTGAAATGTCTCACAC

3 dna:chromosome chromosome:082214v1:3:1:564427874:1
position: 418615933-418615947

CGCTATGTAATGAGCTCCAACAATATTTTA418615933TTCATTGACAACATTTAGAGCCCATTTGGGACAGCTCTGCTCCTT

5 dna:chromosome chromosome:082214v1:5:1:561411686:1
position: 119548036-119548050

TTTGGCTCAGGTTTACCCTCTTGCCTATTT119548036TTCATTGACAACATTTGTCAGTATATCGCTTCTAATTTTACTCAG

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28177/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.086 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28177/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.089 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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