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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-24 16:16:09, GGGenome : Vitis vinifera genome, IGGP_12x (Jun, 2011)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

2 dna:chromosome chromosome:IGGP_12x:2:1:18779844:1
position: 12001041-12001055
GCCCTAAGCTCACGAGTCAGAGTCTTTCAT12001041TTCATTGACAACATTAAGTTGTGCATAACTTCTAGAGCCTTGAGC
15 dna:chromosome chromosome:IGGP_12x:15:1:20304914:1
position: 10155767-10155781
TGCCTTTAAATTTATAAAAATAAAATAAAA10155767TTCATTGACAACATTTAAATAATAAAAAAATCTAGTAATTAACAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/IGGP_12x/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : IGGP_12x | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.070 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28204/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28204/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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