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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2024-03-29 06:04:40, GGGenome : Leersia perrieri genome, Lperr_V1.4 (Mar, 2014)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

5 dna:chromosome chromosome:Lperr_V1.4:5:1:20807039:1
position: 5923116-5923130
TATGATTGAGCACTCCTACCTACTTTGCAA5923116AATGTTGTCAATGAACTGTTTGTTCGCTGCATAAATGTTCAATGA
5 dna:chromosome chromosome:Lperr_V1.4:5:1:20807039:1
position: 18768258-18768272
TCCTTCATAAATTACCTGAGTGAAACGGAA18768258AATGTTGTCAATGAACAGAAGCACATCTTGTCCTTCAGCATCACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Lperr_V1.4/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Lperr_V1.4 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.077 | 0.069 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28178/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.081 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28178/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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