GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-12-04 17:43:27, GGGenome : Manihot esculenta genome, v6.1

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Chromosome10:23532639-23532653
CAATGTTTCTCTTTCTGTTCGAGAAGATTA23532639TTCATTGACAACATTCCATAAGTAGAAAGAAAATGTCAAACTCTT
Chromosome12:27849680-27849694
ATAGAAAATTGTTGTATGTATGTTGTGTGA27849680AATGTTGTCAATGAATAAGGAAGCAAAGAAATTAAATAAAGTAAA
Chromosome16:5868373-5868387
TTCTATATTTAGTAGGTTTTTCACTTTAAT5868373AATGTTGTCAATGAACAATTTCTTTTTGTGTTTTTTTTTTTTTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Mesculenta_v6/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Mesculenta_v6 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
0.092 | 0.082 | search_plus_done; http://172.18.8.74:28304/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.097 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.74:28304/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.099 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).