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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2024-11-22 03:31:12, GGGenome : Mnemiopsis leidyi genome, MneLei_Aug2011 (Sep, 2011)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

ML0613 dna:supercontig supercontig:GCA_000226015.1:ML0613:1:41816:1
position: 17013-17027
GTGCTGGTTTACTAATATGATTAGGCAGAG17013TTCATTGACAACATTACACGTGACCGCTATAAGTTTATTGTGTAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/MneLei/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : MneLei | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28152/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28152/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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