GGGenome | Results

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2025-04-06 12:35:05, GGGenome : Pediculus humanus genome, PhumU2 (Nov, 2008)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

DS235371 dna:supercontig supercontig:PhumU2:DS235371:1:284323:1
position: 78574-78588

CACGTTCGCTCTTTTTTCTCACTCCCCCCC78574TTCATTGACAACATTCGCGCACGAAACGTTGTTAACTAATCCGTG

DS235283 dna:supercontig supercontig:PhumU2:DS235283:1:462513:1
position: 341788-341802

TTTTTTTTTTCACAACGAAAATTATCCATT341788TTCATTGACAACATTTGAAAATCAGGATCAGGGTCTTATCCTTAA

DS234996 dna:supercontig supercontig:PhumU2:DS234996:1:474860:1
position: 111643-111657

AAATATTATAGGATCTAATTCTTCTCCTTT111643TTCATTGACAACATTTGTAAAAGCCGTTGCCCACGGTTGTCCTAT

Data Export:

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28156/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.089 | 0.006 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28156/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.089 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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