GGGenome | Results

2024-12-27 13:39:39, GGGenome : Amazon molly genome, Poecilia_formosa-5.1.2 (Oct, 2013)

Summary:

Results:

KI519901.1 dna:scaffold scaffold:PoeFor_5.1.2:KI519901.1:1:796020:1 REF
position: 467975-467989

ATATAGCATAACATAAAACCAAGATTTTAT467975TTCATTGACAACATTTCCTGGATGTTTTCTTTTTTTTTTAAATCA

KI519617.1 dna:scaffold scaffold:PoeFor_5.1.2:KI519617.1:1:5572511:1 REF
position: 4799141-4799155

TACCAACCTGAGCTTCTTAACTGTGATGTA4799141AATGTTGTCAATGAACAGGACATATTAGCTGTGGTTGTCAGAAAA

KI519705.1 dna:scaffold scaffold:PoeFor_5.1.2:KI519705.1:1:2098595:1 REF
position: 1126569-1126583

TATTAGATCCTGCAGCTACTCAGCAAACAT1126569AATGTTGTCAATGAATGTAGAAATCTGCATGGCAGTGCAGTTGGT

KI519984.1 dna:scaffold scaffold:PoeFor_5.1.2:KI519984.1:1:605445:1 REF
position: 181323-181337

TTCCTTCTTGCATCCGAAATCCGGCCTCAA181323AATGTTGTCAATGAAGAAGTTTGTTGTTCTGTTGGTCTGTGGGCC

KI519987.1 dna:scaffold scaffold:PoeFor_5.1.2:KI519987.1:1:532583:1 REF
position: 143237-143251

AAATAAAGCGATTCTGGGAAGCCTCTCGTC143237AATGTTGTCAATGAACACATTGAAGACCTGCAGGTTTGGGTTACA

KI520061.1 dna:scaffold scaffold:PoeFor_5.1.2:KI520061.1:1:417825:1 REF
position: 113216-113230

TTTTAGTTACAGATGAGTCGTCTATTTGAT113216AATGTTGTCAATGAAGGCTAGCGGTAATCGCTGTTGATAGGAACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

タブ区切りテキスト → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトに直接コピペできます。
CSV形式 → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトにて開くことができます。
BED形式 → リンク | ダウンロード
GFF形式 → リンク | ダウンロード
JSON形式 → リンク | ダウンロード

Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.080 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28118/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28118/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.087 | 0.003 | cgi_end;