GGGenome | Results

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2025-04-06 10:33:43, GGGenome : Strigamia maritima genome, Smar1 (Feb, 2013)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

JH431854 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH431854:1:146329:1
position: 33690-33704

CAACCAAAACCACAAAACAACATAAATCTT33690TTCATTGACAACATTCAATGGCAAAACACATATAGCATCATGAAC

JH432105 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH432105:1:558451:1
position: 552321-552335

CCATATAGAAATATGGAAAAATAGTTCACT552321TTCATTGACAACATTGTTCTCTCTCTTTCTAAATGAAATATAGAA

JH431380 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH431380:1:254879:1
position: 237282-237296

ATCATTCTCTATAAAACGTAGAAAAAGAAA237282AATGTTGTCAATGAAAAGGTCAGGTCGGCTTTCAACTCTGATATA

JH432114 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH432114:1:1273652:1
position: 1025624-1025638

TCGTGTTTCGAGGCATATATTTTTGTTTTA1025624AATGTTGTCAATGAACAATAATAATTCGAGCGCTGTTTATTATGT

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28160/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.087 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28160/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.089 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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