GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-05-04 08:47:00, GGGenome : Tribolium castaneum genome, Tcas3 (Feb, 2010)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

ChLG4:2199433-2199447
AAATAAAAAATATTAAGAGACTGATTTTTT2199433TTCATTGACAACATTTTTTTTACCCAACTTAAAACTTATACACCC
Unknown:7525316-7525330
AACTTTAGCAACCTTGCCGAGATTTATTTC7525316AATGTTGTCAATGAACGAAAATTTAATTTGAATGGTTGTAAGTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Tcas3/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Tcas3 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28162/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.085 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28162/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.085 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).