GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-01-05 14:39:20, GGGenome : Theobroma cacao genome, Theobroma_cacao_20110822 (May, 2014)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

9 dna:chromosome chromosome:GCA_000403535.1:9:1:42035188:1
position: 6168650-6168664
TCTGTCCATTCATATATAGGGAAAAGAAAA6168650TTCATTGACAACATTTTAATAACAAAAAAAAAACAAAAGTAAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Thecc_20110822/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Thecc_20110822 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.078 | 0.069 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28201/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28201/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.082 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).