GGGenome | Results

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2025-04-06 04:22:37, GGGenome : Citrullus lanatus subsp. vulgaris (Charleston Gray) genome, v1

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

CG_Chr03
position: 18984140-18984154

GCAGCATTCCACGACACATTCGTAATAGTC18984140TTCATTGACAACATTTTGGTGTATTCTCGAACCGAGGCTGAGCAC

CG_Chr04
position: 18294644-18294658

AAGCACGAGGACAAAATAAGAAGGAACAAC18294644TTCATTGACAACATTCTTCTGTTTGGTAAGGTTTAACAAACAAGT

CG_Chr06
position: 1725798-1725812

TGAATTACTTCAAACATGACTTAACTTAGT1725798TTCATTGACAACATTAAAATTAACGTACTGCAACAGGGGTGCCAA

CG_Chr06
position: 7645805-7645819

TGAAGAAGATTGTGAGCTGTTGTCTTGAGT7645805TTCATTGACAACATTGAAGACTGTACCACGGAAAGATTGAAAAGA

CG_Chr02
position: 14153859-14153873

CCAAAAATGTTCTAAAAGGTAGCTAAGTCA14153859AATGTTGTCAATGAAAACCATGTAAAAGGCTCATAAAAAGTATCT

CG_Chr05
position: 19161869-19161883

AAAAAGTGTTCTTAAAAGGTAACTAAGTCA19161869AATGTTGTCAATGAAAACCATGTAGAAGGTTACTGAAAAGTGTCC

CG_Chr05
position: 34262451-34262465

CACAAGCTTGCTTACCTGGGTAAAACGGAA34262451AATGTTGTCAATGAAGAGAAGCACATCTTGCCCTTCAGCATCACG

Data Export:

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28214/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.090 | 0.007 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28214/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.092 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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