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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-12-27 16:38:07, GGGenome : Xenopus tropicalis genome, XenBase/UCB 10.0

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Chr2:
157800311-157800325
AGGGAGTGGTGTGTGGAACTGGTATTCCAG157800311TTCATTGACAACATTACCTTGAAATAAATGGGGTTTGGAGGCAGA
Chr1:
44658551-44658565
GGAGCGATTTGCACAGAAGAAACCTGGATA44658551AATGTTGTCAATGAACGCACAGTTGCAGTCATAACTGAACCCTAT
Chr2:
67044379-67044393
TTGTTCATCGGTACCGGACCATATAAGAAT67044379AATGTTGTCAATGAAGCAACCAAAATATTGAATATTGTGAGAGTG
Chr4:
103557268-103557282
CCAATAGCTTTGGGAATGAGCAGTGTAAGC103557268AATGTTGTCAATGAAACAAAATTATACAGGCCAATAACTTATTAT
Chr7:
83646571-83646585
CTTCACATTATTTTATAAACTTCTCAATAC83646571AATGTTGTCAATGAATGTGGTATTTTCACATTTTCAGATGCCCGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Xentr10.0/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Xentr10.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28889/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28889/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.086 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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