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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-23 22:34:26, GGGenome : Golden eagle genome, aquChr-1.0.2/aquChr2 (Oct, 2014)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KN265653v1:6072095-6072109
CCCTGCCACAGTTTGCCCACTGCTAGCTTG6072095AATGTTGTCAATGAACACTGTAGAAAGGTGTGATGTTGCTGTGCT
KN265663v1:2926063-2926077
GTTAAAAATATATATATGCAGCTTAAAGGA2926063AATGTTGTCAATGAATAAAATAATTATTAAAATATCAGTAATTGT
KN265693v1:7229413-7229427
TTGTTATTAAATGATGGACATTGGACATCC7229413AATGTTGTCAATGAAAAGTATTATTAAAATTCATGTTCTAGATAA
KN265692v1:8019863-8019877
GATCTAGTATTTTGTCCCATCTAAAAACTG8019863TTCATTGACAACATTAAGGAACACTGTCTGAATGCTGAAGCCATC
KN265795v1:525652-525666
TACAGTACTCTAAATAACTCACTGTAATAT525652TTCATTGACAACATTATTTTGTGCATTGTATGGTTCTTGTAATTT
KN265812v1:166390-166404
CATGATAACAATCTGTGTCATGTAATTGAG166390TTCATTGACAACATTTAAATAATCCATTGCTCGTTTCCATTGTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/aquChr2/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : aquChr2 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28760/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28760/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.085 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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