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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-04-29 04:34:36, GGGenome : C. remanei genome, WUGSC 15.0.1/caeRem3 (May, 2007)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chrUn:108941169-108941183
AAAAAAGTTCAGAAAAATCAATGTTTTCTC108941169TTCATTGACAACATTGTAAATCACAACAAATTTGCAGATTCAAGT
chrUn:138795702-138795716
CGTGACCAGGAAGGACAAGATGTGCTTCTC138795702TTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACTCAAGCCGGATCAGAAGTG
chrUn:3831058-3831072
GGCGAAGAATAATACGAGATTTTGCGGGAA3831058AATGTTGTCAATGAAAACGTACAAATATCAAATGCGTACTTTTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/caeRem3/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : caeRem3 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.079 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28111/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28111/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.083 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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