# [ GGGenome | 2025-04-05 08:48:46 ] # database: DDBJ release 134.0 (Mar, 2024) # query: TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA # count: 12 # query: TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA # count: 18 # name strand start end snippet snippet_pos snippet_end query sbjct align edit match mis del ins CN945508|CN945508.1 011010AVBC127026PG (AVBC) Royal Gala young shoot Malus domestica cDNA clone AVBC127026, mRNA sequence. + 42 65 GAAGATGTTCGGCTTCAGGCAATCATTTCTCTGAAACATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGAAGGACAAGCAAGGGCTAAGGAAATTCTGGATACTGTGATGAACACTTATATCAAGACTATGACTGAAGATGATGACAAGGAAGTT 1 165 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 JR624385|JR624385.1 TSA: Pyrus x bretschneideri Unigene31479_XinShao mRNA sequence. + 349 372 ATGCACCCTATTTGGAGGAATCATTTAAGATCCTAGTACGACACTCAGGGTATTTCCATGAAGATGTTCGGCTTCAGGCAATCATTTCTCTGAAACATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGAAGGACAAGCAAGGGC 249 402 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141917|CP141917.1 Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 8. + 1578078 1578101 AATTTTTATTGAGTATAGTCTTACTTTTCTGTAGATTGTATGATATTTAATATCACTTGTCCATTAACAACTATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGCCGTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATGCAAGTGTGCAGTGCATGTCATGATCCCTG 1577978 1578201 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141924|CP141924.1 Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 15. + 2209697 2209720 TAATTTCATTGAGTACTGTCTTGTTTTTCTGTAAATTGTATGATATTAATATCACTTGTTCATTAACAACTCATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGTCATCATCATCATCTCTCTCTCTCTCTCAACTTCAAACACCTGTTTCATTTACATATTTAGTATTGATCTGTACATGCA 2209597 2209820 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141934|CP141934.1 Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 8. + 1620400 1620423 AATTTTTATTGAGTATAGTCTTGCTTTTCTGTAGATTTTATGATATTTAATATCACTTGTCCATTAACAACTATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGCCGTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATGCAAGTGTGCAGTGCATGTCATGATCCCTGTTATTTGGTTTT 1620300 1620523 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141941|CP141941.1 Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 15. + 3088504 3088527 AATTTTCATTGAGCACTGTCTTGTTTTTCTGTAAATTGTATGATATTAATATCACTTGTTCATTAACAACTCATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGTCATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCTCTGTAACTACTGAATTCTTCCATGTT 3088404 3088627 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141960|CP141960.1 Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 8. + 1626405 1626428 AATTTTTATTGAGTATAGTCTTACTTTTCTGTAGATTTTATGATATTTAATATCACTTGTCCATTAACAACTATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGCCGTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATGCAAGTGTGCAGTGCATGTCATGATCCCTGTTATTTGGTT 1626305 1626528 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141967|CP141967.1 Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 15. + 2315395 2315418 TAATTTCATTGAGTACTGTCTTGTTTTTCTGTAAATTGTATGATATTAATATCACTTGTTCATTAACAACTCATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGTCATCATCATCATCTCTCTCTCTCTCAACTTCAAACACCTGTTTCATTTACATATTTAGTATTGATCTGTACATGCAAG 2315295 2315518 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141977|CP141977.1 Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 8. + 1693200 1693223 AATTTTTATTGAGTATAGTCTTGCTTTTCTGTAGATTTTATGATATTTAATATCACTTGTCCATTAACAACTATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGCCGTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACATGCAAGTGTGCAGTGCATGTCATGATCCCTGTTATTTGGTTTTGC 1693100 1693323 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP141984|CP141984.1 Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 15. + 2244611 2244634 TAATTTCATTGAGTACTGTCTTGTTTTTCTGTAAATTGTATGATATTAATATCACTTGTTCATTAACAACTCATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGTCATCATCATCATCTCTCTCTCTCTCAACTTCAAACACCTGTTTCATTTACATATTTAGCATTGATCTGTACATGCAAG 2244511 2244734 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OY720325|OY720325.1 Malus x robusta genome assembly, chromosome: 1. + 2085916 2085939 AATTTTCATTGAGCACTGTCTTGTTTTTCTGTAAATTGTATGATATTAATATCACTTGTTCATTAACAACTCATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCATAATGTTAGTGGTCATCATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCAACTTCAAACACCTGTTTCATTTACATATTTAGTATTGATCTGTACATGCAA 2085816 2086039 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OY756938|OY756938.1 Crataegus laevigata genome assembly, chromosome: 1. + 2627212 2627235 ATTTGTATTGAGTACTGTCTAGTTTTTCTTTAAATTGTATGATATTTAATTTCACTTGTCCGTTAACAACTCATGTTTGGTTGATTTCAAATACAGATATTTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTACCAGAATCCTAATGTTAGTGGCCACCATCATCATCATCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCCTTTCTCTCCCACTCCCTCCCTCTCTAACTACTAACT 2627112 2627335 TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA TTTAACAGCAGCACAGGCAGTTTA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP143365|CP143365.1 Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 8. - 29772286 29772309 AAGTTTGCAAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 29772186 29772409 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP143372|CP143372.1 Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 15. - 53777748 53777771 TCAACATGGAAGAAGTCAGTAGTTACAGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTGCACAATCAAAATT 53777648 53777871 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP143382|CP143382.1 Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 8. - 30809030 30809053 GTTTGCAAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAAGTTGTTAATGGATAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACAATACTCAATAAAAAT 30808930 30809153 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 CP143389|CP143389.1 Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 15. - 47325894 47325917 CTTGCATGTACAGATCAATACTAAATATGTAAATGAAACAGGTGTTTGAAGTTGAGAGAGAGAGAGATGATGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTACTCAATGAAATTA 47325794 47326017 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU696510|OU696510.1 Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 8. - 28711178 28711201 GTTTGCAAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 28711078 28711301 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU696517|OU696517.1 Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 15. - 51904636 51904659 TCAACATGGAAGAATTCAGTAGTTACAGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTGCTCAATAAAAATT 51904536 51904759 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU696684|OU696684.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 8. - 28464009 28464032 AAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 28463909 28464132 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU696691|OU696691.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 15. - 53592756 53592779 TCAACATGGAAGAATTCAGTAGTTACAGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTGCTCAATAAAAATT 53592656 53592879 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU744549|OU744549.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 8. - 28971597 28971620 GCAAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 28971497 28971720 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU744556|OU744556.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 15. - 53333830 53333853 TCAACATGGAAGAATTCAGTAGTTACAGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTGCTCAATAAAAATT 53333730 53333953 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU744960|OU744960.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 8. - 28769783 28769806 AAGTTTGCAAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 28769683 28769906 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU744967|OU744967.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 15. - 53900882 53900905 TCAACATGGAAGAATTCAGTAGTTACAGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTGCTCAATAAAAATT 53900782 53901005 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU744998|OU744998.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 8. - 29674418 29674441 AAGTTTGCAAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 29674318 29674541 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OU745005|OU745005.1 Malus domestica genome assembly, chromosome: 15. - 52927697 52927720 TCAACATGGAAGAATTCAGTAGTTACAGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGATGACCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTTACAGAAAAACAAGACAGTGCTCAATAAAAATT 52927597 52927820 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OY720340|OY720340.1 Malus x robusta genome assembly, chromosome: 16. - 29005459 29005482 AAAACCAAATAACAGGGATCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACTATACTCAATAAAAATT 29005359 29005582 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OY756949|OY756949.1 Crataegus laevigata genome assembly, chromosome: 12. - 33909804 33909827 CCATGACATGCACTGCACACTTGCATGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGATGACAGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACAATACTCAATAAAAAT 33909704 33909927 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OY757068|OY757068.1 Pyrus communis genome assembly, chromosome: 1. - 41937180 41937203 ATTAAGTAATAAAAAATCAGACATGATTCAACATGGAAGAAGTCAGTAGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGAATGGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATGAGTTGTTAATGAACAAGTGATATTAATATCATACAATTAACAGAAAAACAAGACAGTACTCAATGAAAATT 41937080 41937303 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0 OY757082|OY757082.1 Pyrus communis genome assembly, chromosome: 15. - 23080713 23080736 TGCACTGCACATTTGCATGTGGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACAGCCACTAACATTATGATTCTGGTAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAAATATCTGTATTTGAAATCAACCAAACATAAGTTGTTAATGGACAAGTGATATTAAATATCATAAAATCTACAGAAAAGCAAGACAATACTCAATAAAAAT 23080613 23080836 TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA TAAACTGCCTGTGCTGCTGTTAAA |||||||||||||||||||||||| ======================== 24 0 0 0