GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 15:52:23, GGGenome : Anopheles gambiae genome, AgamP4 (Apr, 2014)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

2L dna:chromosome chromosome:AgamP4:2L:1:49364325:1
position: 30115449-30115463
ACGATTACTTATTTGTCTTAAATTGAAGCA30115449TTCATTGACAACATTTAAAGAAAATACTTTTTGTTGTTACTATTT
3R dna:chromosome chromosome:AgamP4:3R:1:53200684:1
position: 45062609-45062623
TCCTCCTTCGCTCTCACACACACACACACC45062609TTCATTGACAACATTGGAAACTACACACATTGAGGAAATTTAAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/AgamP4/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : AgamP4 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28016/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.086 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28016/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.086 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).