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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-01 11:25:38, GGGenome : Cucumis melo genome, v3.5.1 (Oct, 2013)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

CM3.5.1_scaffold00049
position: 131555-131569
TCCAAGATTGTAGAAATGATAGAAAGAAAT131555AATGTTGTCAATGAATTTCGAACTTTTGTGGTTTGATGATGATGC
CM3.5.1_scaffold00015
position: 4956818-4956832
AATCATCTCCTGAGACATTCCACCAAACAT4956818AATGTTGTCAATGAAGGGATGAAAACTCTTTACAGCGGAAGAATT
CM3.5.1_scaffold00005
position: 4054750-4054764
TTTTGGCATATTTACCTGGGTAAAGCGGAA4054750AATGTTGTCAATGAAGAGAAGCACATCCTGTCCTTCAGCATCACG
CM3.5.1_scaffold00050
position: 1574831-1574845
AAGGACTTCCTAGACTCGTTCGTCATAGTT1574831TTCATTGACAACATTTTGATTTACTCCAAAATTGAGGCTGAGCAT
CM3.5.1_scaffold00034
position: 889015-889029
TTTTTTTTCCCTTTAATGAATAATTAAACT889015TTCATTGACAACATTTGGGAGTAAAAACCTCTTTCTATTCAATAA
CM3.5.1_contig35642
position: 63-77
AAGGATTTTTTAGACACGTTCGTCATAGTT63TTCATTGACAACATTTTGATTTACTTTTGTTTGCTTTGTTTGCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/CM3.5.1/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : CM3.5.1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.070 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28279/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28279/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.086 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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