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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-12-28 18:35:13, GGGenome : Populus trichocarpa genome, v3.0

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Chr01:35801083-35801097
CTCTTGGCAGAAACGGATGCTAAATTTCAT35801083AATGTTGTCAATGAAACTATGTTTTTGTGCTGATGTGCTTGAAAA
Chr08:3100148-3100162
ACTGATTAGCTGCTGAACTTTTGGCTTCTC3100148AATGTTGTCAATGAATCGTCTAGATAATGGTTCGCAAACTGGGAG
Chr10:13456026-13456040
GGCATCCAATTTTACCTGGGTAAAGCGGAA13456026AATGTTGTCAATGAATAGAAGCACATCTTGCCCTTCAGCATCACG
Chr02:391325-391339
AAATGGGATGAAAAGATGGAAGAAGCTGCA391325TTCATTGACAACATTGGCTGCTACAGGCGTTATACGTTTGATAGT
Chr03:179308-179322
CCCTCCTTGATCATTCTTTGGCCTCTTCAA179308TTCATTGACAACATTTTTCAACCTATCTCTTTCTTCAGTAACCAT
Chr08:8266306-8266320
CGTGATGCTGAAGGGCAAGATGTGCTTCTC8266306TTCATTGACAACATTTTCCGCTTTACCCAGGTAAAATTCAATGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Ptrichocarpa_v3.0/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : Ptrichocarpa_v3.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.078 | 0.069 | search_plus_done; http://172.18.8.74:28312/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.74:28312/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.085 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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