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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2024-11-05 13:31:29, GGGenome : A. gambiae genome, IAGEC MOZ2/anoGam1 (Feb, 2003)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

chr2L:29546211-29546225
ACGATTACTTATTTGTCTTAAATTGAAGCA29546211TTCATTGACAACATTTAAAGAAAATACTTTTTGTTGTTACTATTT
chr3R:45751612-45751626
TCCTCCTTCGCTCTCACACACACACACACC45751612TTCATTGACAACATTGGAAACTACACACATTGAGGAAATTTAAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/anoGam1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : anoGam1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28093/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.086 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28093/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.086 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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