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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 15:29:07, GGGenome : Marmoset spliced RNA, TRaC 20.03 protein coding on calJacRKC1912, D3G 20.03 (Mar, 2020)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

ENSCJAG00000014861;TRaC2003L1a84b|MIR4785|chr6:92541779:92607037:-|spliced
position: 1184-1198
AAGTTCCAAAGTAAATTTGCATTATATGCT1184AATGTTGTCAATGAATAGAATATAAATGTGCTACTTTGCTGCAAT
ENSCJAG00000014861;TRaC2003L1a84c|RBMS1|chr6:92557172:92686106:-|spliced
position: 1297-1311
AAGTTCCAAAGTAAATTTGCATTATATGCT1297AATGTTGTCAATGAATAGAATATAAATGTGCTACTTTGCTGCAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/calJacRKC1912_Trac2003ProtCoding_spliced_d3g2003/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : calJacRKC1912_Trac2003ProtCoding_spliced_d3g2003 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28814/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.088 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28814/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.088 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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