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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 15:10:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Phorcus lineatus genome assembly, chromosome: 11.
OV121091.1:6287272-6287291
GCCTAGTTGTAGGAGTAGGGAACTTGTCAC6287272AAACGCCATGATGGACAAGTCCACCTCTGTTAAAAAAAAACACGATTACA
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL008a08_r, 5'end.
AU190842.1:97-116
TCTTTGAGACCACCGTGCCGCACCTACCCG97ACTTGTCCATCATGGCGTTTGTGGGCGCTGCCGTTGGCGATCGCGGCGCG
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL094g02_r, 5'end.
AU196781.1:107-126
TCTTTGAGACCACCGTGCCGCACCTACCCG107ACTTGTCCATCATGGCGTTTGTGGGCGCTGCCGTTGGCGATCGCGGCGCG
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL095h09_r, 5'end.
AU196855.1:107-126
TCTTTGAGACCACCGTGCCGCACCTACCCG107ACTTGTCCATCATGGCGTTTGTGGGCGCTGCCGTTGGCGATCGCGGCGCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAACGCCATGATGGACAAGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAACGCCATGATGGACAAGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.112 | 0.103 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAACGCCATGATGGACAAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.152 | 0.040 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTTGTCCATCATGGCGTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.154 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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