GGGenome | Results

2025-04-09 11:02:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

MUC4LC1003_H06_.b_048. Musa acuminata leaves COLD stress Musa acuminata subsp. burmannicoides cDNA 5', mRNA sequence.
DN239317.1:445-464

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA445AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCCGACCATTAAGATTTTGTTCTTCTG

MA4LIMFES004A_MA4LIMFES004A_G10_.b_072 MA4LIMFES Musa acuminata cDNA clone MA4LIMFES004A_MA4LIMFES004A_G10_.b_072 5', mRNA sequence.
JK533583.1:362-381

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA362AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCCGACCATTAAGATTTTGTTCTTCTG

MA4LIMFES014A_MA4LIMFES014A_G07_.b MA4LIMFES Musa acuminata cDNA clone MA4LIMFES014A_MA4LIMFES014A_G07_.b 5', mRNA sequence.
JK533599.1:362-381

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA362AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCCGACCATTAAGATTT

MAC4-66H07 MA4LIMFES Musa acuminata cDNA clone MAC4-66H07 5', mRNA sequence.
JK533618.1:247-266

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA247AAACGTACCATCTTCCGTGC

TSA: Musa acuminata AAA Group Unigene12640_NK1 mRNA sequence.
JV435740.1:38-57

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA38AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCCGACCATTAAGATTTTGTTCTTCTG

Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 6.
CP126375.1:37018641-37018660

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA37018641AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCCGACCATTAAGATTTTGTTCTTCTG

Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 17.
CP126386.1:35842202-35842221

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA35842202AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCCGACCATTAAGATTTTGTTCTTCTG

Musa acuminata subsp. malaccensis strain Doubled-haploid Pahang (DH-Pahang) genome assembly, chromosome: A06.
HG996471.1:36729856-36729875

ACAGAGACTACCTCGAGTACAACGATCCCA36729856AAACGTACCATCTTCCGTGCTTTGCTGACCATTAAGATTTTGCTCTTCTG

TSA: Musa acuminata AAA Group Unigene11987_B1 mRNA sequence.
JV357414.1:222-241

CAGAAGAACAAAATCTTAATGGTCGGCAAA222GCACGGAAGATGGTACGTTTTGGGATCGTTGTACTCGAGGTAGTCTCTGT

Musa schizocarpa genome assembly, chromosome: S06.
LS990921.1:40229548-40229567

CAGAAGAGCAAAATCTTAATGGTCAGCAAA40229548GCACGGAAGATGGTACGTTTTGGGATCGTTGTACTCGAGGTAGTCTCTGT

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.492 | 0.483 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAACGTACCATCTTCCGTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.538 | 0.046 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCACGGAAGATGGTACGTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=42
0.539 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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