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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-16 21:47:15, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Mus musculus NOD/MrkTac GSS, clone DN-277G23 5' sequence.
FR165276.1:18-36
TTATGTAATTCTCTGAG18ATATCCAGAGACCCCTGTTTGAGGGAAATTCTGGTTAAAATCATAACTT
Pinctada fucata DNA, chromosome 3, nearly complete sequence, Alternate Pseudohaplotype.
AP027118.1:3175972-3175990
TGCTATGCGGTCACTTCTGATCTGTTTGTT3175972ATATCCAGAGACCCCTGTTTCTGAATATTTATTCCGCCGTCTTAGGAAA
Bolma rugosa genome assembly, chromosome: 4.
OZ209839.1:124303763-124303781
CTGACTCAGTTGTATAAGACAGGGGATGAA124303763ATATCCAGAGACCCCTGTTTCACAAAGCAATCTCAGCATTATAATGTCA
Rana temporaria genome assembly, chromosome: 12.
LR991691.1:135766426-135766444
ATACCATCATCGGTGGAATATTCCTTCTTT135766426ATATCCAGAGACCCCTGTTATCTGTGGAACATCTCTCCTGAATATAGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACAGGGGTCTCTGGATAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACAGGGGTCTCTGGATAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.363 | 0.354 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AACAGGGGTCTCTGGATAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.514 | 0.151 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=ATATCCAGAGACCCCTGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.517 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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