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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-12-18 17:31:43, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Solanum dulcamara genome assembly, chromosome: 11.
OX359262.1:45052667-45052690
AAATATGTGACTAACTGCAAAGAGTCTTGT45052667GGATCAACTGAAGAGCTGGTGGTTTTGCGCCAACTATTCTAAACCTGGCACTGT
Solanum nigrum genome assembly, chromosome: 34.
OZ176045.1:47573317-47573340
ATGTGACTAACTAGTTGCAAAGGGTCTTGT47573317GGATCAACTGAAGAGCTGGTGGTTTTGCGGCAACTATTCTAAACCTGGCACTGT
Solanum nigrum genome assembly, chromosome: 35.
OZ176046.1:44808101-44808124
ATGTGACTAACTAGTTGCAAAGGGTCTTGT44808101GGATCAACTGAAGAGCTGGTGGTTTTGCGGCAACTATTCTAAAGCTGGCACTGT
Solanum nigrum genome assembly, chromosome: 36.
OZ176047.1:42126756-42126779
ATGTGACTAACTAGTTGCAAAGGGTCTTGT42126756GGATCAACTGAAGAGCTGGTGGTTTTGCGGCAACTATTCTAAACCTGGCACTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACCACCAGCTCTTCAGTTGATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACCACCAGCTCTTCAGTTGATCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.255 | 0.245 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AACCACCAGCTCTTCAGTTGATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.344 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GGATCAACTGAAGAGCTGGTGGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.347 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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