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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 02:02:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Raphanus sativus var. sativus RNA, contig: WG3_8568.
FX669629.1:990-1011
GCTCAACAGCGCTGAAAACACCAGTGTGCA990ACTCAAGCCCATCGACTACGTTAACGAGCTTTCCTTTGAACCTCTCCAAGCA
RR1CP78TF RR1(CS) Raphanus raphanistrum subsp. maritimus cDNA 5', mRNA sequence.
EX749681.1:545-566
TGCTTGGAGAGGTTCAAAGGAAAGCTCGTT545AACGTAGTCGATGGGCTTGAGTTGCACACTGGTGTTTTCAGCGCTGTTGAGC
RS2EI44TF RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 5', mRNA sequence.
EY941453.1:537-558
TGCTTGGAGAGGTTCAAAGGAAAGCTCGTT537AACGTAGTCGATGGGCTTGAGTTGCACACTGGTGTTTTCAGCGCTGTTGAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACTCAAGCCCATCGACTACGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACTCAAGCCCATCGACTACGTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.132 | 0.123 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTCAAGCCCATCGACTACGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.319 | 0.187 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACGTAGTCGATGGGCTTGAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.320 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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