GGGenome | Results

2025-04-16 01:47:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

UCRCS07_7D10_b Parent Washington Navel Orange Thrip-Challenged Flavedo cDNA Library UCRCS07 Citrus sinensis cDNA clone UCRCS07-7D10-G19-1-7.b, mRNA sequence.
CX046351.1:296-315

TAATACACGGGAACGTGCTCGTCAGCTGTT296AGCCAATGGGATTTCTGACATTCCAGAGGATATAGCTTATACTCATGTGG

CS00-C1-102-107-F10-CT.F Sweet orange leaf, infected with Xylella fastidiosa (stage 2 of 2) Citrus sinensis cDNA, mRNA sequence.
EY672317.1:152-171

TAATACACGGGAACGTGCTCGTCAGCTGTT152AGCCAATGGGATTTCTGACATTCCAGAGGATATAGCTTATACTCATGTGG

TSA: Elaeocarpus photiniifolius mRNA, contig: Ep_rep_c542.
FX134437.1:1065-1084

TAATACACGTGAACGATCTCGGCATTTATT1065AGCCAATGGGATTTCTGACATTCCAGACGAAGCATCTTTCACCAATGTTG

Ailanthus altissima genome assembly, chromosome: 6.
OX327688.1:10590289-10590308

TAACACACGGGAACGTGCTCGTCAGCTGTT10590289AGCCAATGGGATTTCTGACATCCCAGAGGAAGCAGCTTATACTAATGTCG

Pungitius pungitius genome assembly, chromosome: 15.
OX438555.1:7618604-7618623

AATTATTTTGTACAATAATCACAAATCCGA7618604TGTCAGAAATCCCATTGGCTTTTTGTTGAGGGAAAAACGTGCAATGCATA

Swietenia macrophylla isolate HCNGB_00002344 chromosome 1.
CP135559.1:11858441-11858460

CCAAATTAGTATAAGCTGCATCCTCTGGAA11858441TGTCAGAAATCCCATTGGCTAACAGCTGACGAGCACGTTCCTGTGTACTA

Swietenia macrophylla isolate HCNGB_00002344 chromosome 28.
CP135579.1:9654180-9654199

CCAAATTAGTGTAAGCTGCATCCTCTGGAA9654180TGTCAGAAATCCCATTGGCTAACAGCTGACGAGAACGTTCCCGTGTATTA

Ailanthus altissima genome assembly, chromosome: 12.
OX327694.1:11372364-11372383

CCACATTAGTATAAGCTGCTTCCTCTGGGA11372364TGTCAGAAATCCCATTGGCTAACAGCTGACGAGCACGTTCGCGTGTATTA

Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 2.
OY754319.1:7388560-7388579

CCACATGAGTATAAGCTATATCCTCTGGAA7388560TGTCAGAAATCCCATTGGCTAACAGCTGACGAGCACGTTCCCGTGTATTA

Pecten maximus genome assembly, chromosome: 3.
LR736840.1:5711939-5711958

TCATTATGTGGCTGATATGTAGGTATTTAC5711939TGTCAGAAATCCCATTGGCTGGCTGCCTAACAAGCTCATTCTACACCAAG

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Debug Info:

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0.195 | 0.186 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCCAATGGGATTTCTGACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.239 | 0.044 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTCAGAAATCCCATTGGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.243 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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