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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-15 02:31:04, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

RS2AL39JQ RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 3', mRNA sequence.
EW728524.1:470-491
CTCTTGAAACCTTTGTTCTAGGTTCCCTGG470AGCGGTTGTTCTGTGGTATGTGCACGGATTGTTGCTCAACGACGGTATTAGG
RS2AL39TF RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 5', mRNA sequence.
EW724046.1:696-717
CTAATACCCGTCGTTGAGCAACAATCCGTG696CACATACCACAGAACAACCGCTCCAGGGAACCTAGAACAAAGGTTTCAAGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCGGTTGTTCTGTGGTATGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCGGTTGTTCTGTGGTATGTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.169 | 0.160 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCGGTTGTTCTGTGGTATGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.249 | 0.080 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACATACCACAGAACAACCGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.250 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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