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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 03:51:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

atr02-12ms4-a02 Atr02 Amborella trichopoda cDNA clone atr02-12ms4-a02 5', mRNA sequence.
CK763884.1:179-198
ATCGGTGCACTGTGCGTGTTGCAGGCAGGT179AGGACCCTTCTCTCCACGATGGCCCACCACCATCACTCCTGAGAGCTTTA
Atr02b_108_G05_C011.g1 FGP Female Amborella trichopoda Amborella trichopoda cDNA clone 122CYu_N10 5', mRNA sequence.
FD440590.1:102-121
ATCGGTGCACTGTGCGTGTTGCAGGCAGGT102AGGACCCTTCTCTCCACGATGGCCCACCACCATCACTCCTGAGAGCTTTA
Atr02b_82_A08_C011.g1 FGP Female Amborella trichopoda Amborella trichopoda cDNA clone 122CUW_A15 5', mRNA sequence.
FD439046.1:321-340
TAAAGCTCTCAGGAGTGATGGTGGTGGGCC321ATCGTGGAGAGAAGGGTCCTACCTGCCTGCAACACGCACAGTGCACCGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGACCCTTCTCTCCACGAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGACCCTTCTCTCCACGAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.170 | 0.161 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGACCCTTCTCTCCACGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.243 | 0.073 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCGTGGAGAGAAGGGTCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.244 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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