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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 17:16:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EST00351 Hemp Uni-ZAP XR cDNA library Cannabis sativa cDNA clone P12nr015, mRNA sequence.
EW700611.1:30-49
CAGAACATTAATGGCCACAGTGACTATTC30CTCCGGTTCTAACTACCCCTCGTGATGATGCTGCTCAGCTTTACCGTGCT
TSA: Cannabis sativa PK13566.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450053.1:273-292
ACAGAACATTAATGGCCACAGTGACTATTC273CTCCGGTTCTAACTACCCCTCGTGATGATGCTGCTCAGCTTTACCGTGCT
Ballota nigra genome assembly, chromosome: 1.
OX344720.1:84122397-84122416
GAGAATCAAAGATGGCGACGGTGAGCATCC84122397CTCCGGTTCTAACTACCCCTCGCGATGATGCTATGCAACTCTACCGTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGGGTAGTTAGAACCGGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGGGTAGTTAGAACCGGAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.092 | 0.083 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGGGTAGTTAGAACCGGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.211 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCCGGTTCTAACTACCCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.213 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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