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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-16 02:51:15, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium pratense cDNA clone:RCE13829.
BB914296.1:294-313
GGGCTGCTATCGGGATGCTAATTATTATAG294AGGTTCTTTGTGTTGTCGGGTAATTTTATTTGTCATCTGGCTTCCTTTAT
Trifolium repens mRNA, clone: WCC15m18_087, unspecified EST.
FY459476.1:262-281
GGGCTGCTATCGGGATGCTAATTATTATAG262AGGTTCTTTGTGTTGTCGGGTAATTTTATTTGTCATCTGGCTTCCTTCTT
Trifolium repens mRNA, clone: WCC25j09_038, unspecified EST.
FY462947.1:287-306
GGGCTGCTATCGGGATGCTAATTATCATAG287AGGTTCTTTGTGTTGTCGGGTAATTTTATTTGTCATCTGGCTTCCTTCTT
Trifolium fragiferum genome assembly, chromosome: 2.
OX940790.1:58954541-58954560
TGCTAAGTCATGCTCTGATTAAATTGTTGC58954541AGGTTCTTTGTGTTGTCGGGTAATTTTATTTGTCATCTGGCTTCCTTCTT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Occ.
CP125842.1:7131876-7131895
AAGAAGGCAGCCAGATGACAAATAAAATTA7131876CCCGACAACACAAAGAACCTGCAACAATTTAATCAGAGTCTGACTTAGCA
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:8147833-8147852
AAGAAGGAAGCCAGATGACAAATAAAATTA8147833CCCGACAACACAAAGAACCTGCAACAATTTAATCACAGACTGACTTAGCA
Thecophora atra genome assembly, chromosome: 1.
OW569397.1:3838784-3838803
TACGACTTGTTACATCATAACTAACAGTTT3838784CCCGACAACACAAAGAACCTGCCAGGGCCAAGTGAGATCCCAAGAGGTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGTTCTTTGTGTTGTCGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGTTCTTTGTGTTGTCGGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.277 | 0.268 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGTTCTTTGTGTTGTCGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.303 | 0.026 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCGACAACACAAAGAACCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.305 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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