GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-18 19:56:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sequence 27 from patent US 10767189.
MV668014.1:166-190
TAAAAATTTATCAGNTCAAAAATATTTTTA166ATAGAGCTGCAATGTTTGGTTGATGGGAATCGAGGAACAAACAAGAATGTGTATC
Gossypium herbaceum isolate Zhongcao1 chromosome 10.
CP106689.1:117431014-117431038
TAAAAATTTATCAGTTCAAAAATATTTTTA117431014ATAGAGCTGCAATGTTTGGTTGATGGGAATCGAGGAACAAACAAGAATGTGTATC
Gossypium hirsutum chromosome 10 SNP marker NG0203481 associated with blue disease resistance genomic sequence.
GU265863.1:166-190
TAAAAATTTATCAGCTCAAAAATATTTTTA166ATAGAGCTGCAATGTTTGGTTGATGGGAATCGAGGAACAAACAAGANTGTGTATC
Gossypium herbaceum isolate GPA1alz chromosome 10.
CP106701.1:2301284-2301308
GATACACACTCTTGTTTGTTCCTCGATTCC2301284CATCAACCAAACATTGCAGCTCTATTAAAAATATTTTTGAACTGATAAATTTTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATAGAGCTGCAATGTTTGGTTGATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATAGAGCTGCAATGTTTGGTTGATG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.166 | 0.157 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAGAGCTGCAATGTTTGGTTGATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.184 | 0.018 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATCAACCAAACATTGCAGCTCTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.185 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).