GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 15:03:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

39RDBRT_UP_048_F07_22JUL2004_053 Brassica rapa 39RDBRT Brassica rapa cDNA 5', mRNA sequence.
CX272976.1:243-262
GAGAGACATGGCTGGTCCTGCTGGGGGTGG243CACTTCACGCAGAATACATGCTCAGCATATTCGACATTTACTTCAAAACT
Zelleria hepariella genome assembly, chromosome: 4.
OX439382.1:11667385-11667404
TTCTTATCGCGCGCGGATTATACTAATCAT11667385CATGTATTCTGCGTGAAGTGCTTAGCTTATTATTGTATTGTATTGTCATA
Ennomos erosarius genome assembly, chromosome: 22.
OY756999.1:4819653-4819672
TCGCGCCTACTTGGTACTTGCGTTGCGATA4819653CATGTATTCTGCGTGAAGTGAAGGCCTACGTAGCGACCCAGACGCCAATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACTTCACGCAGAATACATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACTTCACGCAGAATACATG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.142 | 0.133 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACTTCACGCAGAATACATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.157 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATGTATTCTGCGTGAAGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.158 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).