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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 17:01:12, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

METCW82TR JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence.
GT144841.1:722-745
ATGTAGATATTATCAAACATATAGAAAGAA722CCGATGTCTCCAACTTTGGATCTG
Medicago truncatula clone mth2-11p13, complete sequence.
AC144375.14:78083-78106
AGTTGCTTGTTTTGCTAGCTGGACTTTTTC78083CAGATCCAAAGTTGGAGACATCGGTTCTTTCTATATGGTAACACTTATTTTGAT
Medicago truncatula clone JCVI-FLMt-18P10 unknown mRNA.
BT137214.1:954-977
AGTTGCTTGTTTTGCTAGCTGGACTTTTTC954CAGATCCAAAGTTGGAGACATCGGTTCTTTCTATATGTTTGATAATATCTACAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCGATGTCTCCAACTTTGGATCTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCGATGTCTCCAACTTTGGATCTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.185 | 0.176 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGATGTCTCCAACTTTGGATCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.202 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGATCCAAAGTTGGAGACATCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.203 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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