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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 05:51:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Xanthomonas citri pv. vignicola strain CFBP7112 chromosome, complete genome.
CP022267.1:2575002-2575021
CAAATGGTGGCCAACGGACGCGGCCGAATC2575002CTCATCACATCTTCGGTCTCGGCAACCATGCCAACGCCCTTCGAGACCGT
JP 2022104707-A/1: Determining methods of carotenoid content in citrus fruits.
PA551512.1:3069-3088
ATGCCATTTTTGCATTTTCAATTTATCCTA3069GAGACCGAAGATGTGATGAGGTGACGCTACATGCTTACTAAGAACAATTC
Citrus reshni phytoene synthase gene, partial cds.
JX630080.1:283-302
ATRCCATTTTTGCATTTTCAATTTATCCAG283GAGACCGAAGATGTGATGAGGTGATGCTACATGCTTACTAAGAACAATTC
Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 9.
OY754326.1:4025688-4025707
ATGCCATTTTTGCATTTTCAATTTATCCTA4025688GAGACCGAAGATGTGATGAGGTGACGCTACATGCTTACTAAGAACAATTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCATCACATCTTCGGTCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCATCACATCTTCGGTCTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.117 | 0.108 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCATCACATCTTCGGTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.229 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGACCGAAGATGTGATGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.231 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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