GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-17 13:47:04, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium pratense DNA, clone:RC0829f.ab1.
DE246144.1:561-580
AATCACCGTCACTTAACAACGCAAATAACA561CTGACACTTAACAACGCAAATAATCATCGTCACTTTAACAACGCAAATAA
Lumbricus terrestris genome assembly, chromosome: 15.
OX457050.1:40719557-40719576
TTAATTTGTATGTTGGTGCCTTATTATTCG40719557CTGACACTTAACAACGCAAAGCTGTTGCTGTTCCTAATTTAACAGTTCTA
Stenurella melanura genome assembly, chromosome: 8.
OY757316.1:43643942-43643961
TATCGGATATGTGGTAAAACCAGAGTTGGC43643942TTTGCGTTGTTAAGTGTCAGCGCATAAGGATTTACATGCTTGTGTGAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGACACTTAACAACGCAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGACACTTAACAACGCAAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.115 | 0.105 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGACACTTAACAACGCAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.131 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTGCGTTGTTAAGTGTCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.132 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).