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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-16 08:17:12, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Polytrichum commune genome assembly, chromosome: 5.
OX485807.1:29307248-29307267
GGATACAGTTCCATACAAAGCAACAAGAAA29307248CTGCTCAAGATGTTCGTCCACAAAATACTGGAGGTGTCTTGTTTTGATAG
Blastomussa wellsi genome assembly, chromosome: 9.
OX393569.1:22388582-22388601
ACAAGAATTCAAGTCAACCTTCAAAACAAC22388582CTGCTCAAGATGTTCGTCCATCCTCAAAATTCCCACAGAAACTCTCTCAG
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT23J23, TM0428.
AP009974.1:30641-30660
ATTTTGGTCGCTTCAATTTGCAGTGCCAAG30641TGGACGAACATCTTGAGCAGGTTCATTATCTTCTTAATAAGACAATACAA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:11266631-11266650
ATTTTGGTCGCTTCAATTTGCAGTGCCAAG11266631TGGACGAACATCTTGAGCAGGTTCATTATCTTCTTAATAAGACAATACAA
Polytrichum formosum genome assembly, chromosome: 5.
OZ037939.1:33834338-33834357
CTATCAAAACAAGATACCGCCAGTATTTTG33834338TGGACGAACATCTTGAGCAGTTTCTTGTTGCTTTGTATGGAACTGTATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTGCTCAAGATGTTCGTCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTGCTCAAGATGTTCGTCCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.276 | 0.267 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTGCTCAAGATGTTCGTCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.412 | 0.136 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TGGACGAACATCTTGAGCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.414 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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