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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-01-09 13:15:22, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Coffea arabica microsatellite DNA, clone ZapII.20.
AJ250253.1:25-44
GGATGTGCTGGCTAGTCAAAGTGG25CTTGTTTGAGTCTGTCGCTGTAATGCTTAAGTTACAGGATGATGGCATCT
Maniola bathseba genome assembly, chromosome: 16.
OZ209561.1:6463498-6463517
CCAATTAACTTTCAATTAAGCTACGACTCT6463498CTTGTTTGAGTCTGTCGCTGGATCAATTGTCGCGAGAGTCTTCGTAATGC
Melanchra persicariae genome assembly, chromosome: 21.
OX376664.1:19220621-19220640
CTTCTGCCGCTCTGCGTAGAGCGGGAGATA19220621CAGCGACAGACTCAAACAAGAGACGTTCCTTCAACGTCCTTTGCGTTCCG
Polia bombycina genome assembly, chromosome: 25.
OZ198310.1:6263328-6263347
ATTACTTACCTGAATCTAAGAATATGGCGC6263328CAGCGACAGACTCAAACAAGTCTCCTAACGCTTTAGGCACCTCCACATCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGTTTGAGTCTGTCGCTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGTTTGAGTCTGTCGCTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.112 | 0.103 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTTGTTTGAGTCTGTCGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.142 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CAGCGACAGACTCAAACAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.144 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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