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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-20 12:01:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT14G02, TM0080.
AP004533.1:37943-37967
GTTAAGTTTCAAGTGAACTAAATTTATATT37943CTTTGCTATAGTTTAGTATTTTGTTCTGAAAAGCTTCACTTCTTTTTAGTTTCTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:63347350-63347374
GTTAAGTTTCAAGTGAACTAAATTTATATT63347350CTTTGCTATAGTTTAGTATTTTGTTTTAAAAAACATCACCTCTATCTAGTTTCTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:7200323-7200347
GTTAAGTTTCAAGTGAACTAAATTTATATT7200323CTTTGCTATAGTTTAGTATTTTGTTCTGAAAAGCTTCACTTCTTTTTAGTTTCTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:56032879-56032903
AAGAAACTACATAGAAGTGAAGTTTTTCAT56032879AACAAAATACTAAACTATAGCAAAGAATATAAATTTAGTTTGCTTGAAACTTAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTTGCTATAGTTTAGTATTTTGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTTGCTATAGTTTAGTATTTTGTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.110 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTTGCTATAGTTTAGTATTTTGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.152 | 0.042 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACAAAATACTAAACTATAGCAAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.153 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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