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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-13 16:49:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Gastracanthus pulcherrimus genome assembly, chromosome: 1.
OX424572.1:209571384-209571403
AATTATAACAATGACTGCTAATAAAATATC209571384GAAAGAGGGAAAATGGAGCCTTCCTCAATGTCATCTTATAATTATCTGTA
KS23053C02 KS23 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD115942.1:7-26
GCACGA7GGCTCCATTTTCCCTCTTTCTTCAATGGCTTCATTTGCTTTTCGAAGCTC
Bemisia tabaci genome assembly, chromosome: 3.
OU963864.1:27778659-27778678
ATAACAATCACCCGTTTCAACCTATGTGAT27778659GGCTCCATTTTCCCTCTTTCTTCTTAGTCTATCAATTTGGACAATCAGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAAAGAGGGAAAATGGAGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAAAGAGGGAAAATGGAGCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.098 | 0.089 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAAGAGGGAAAATGGAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.214 | 0.116 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTCCATTTTCCCTCTTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.216 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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