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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 02:10:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RS2AD76JQ RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 3', mRNA sequence.
EW728408.1:309-330
AAATACTTGCAATCCAAGCTTGAAAGCTAT309GAGGAGGACAACTCAAGCACAATAAGTTCCTCAGTCATTTGAGACCTCCCAA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 1.
LR778310.1:19870712-19870733
TTGGGAGGTCTCAAATGACTGAGGAACTTA19870712TTGTGCTTGAGTTGTCCTCCTCATAGCTTTCAAGCTTGGATTGCAAGTATTT
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 6.
OY743212.1:19870712-19870733
TTGGGAGGTCTCAAATGACTGAGGAACTTA19870712TTGTGCTTGAGTTGTCCTCCTCATAGCTTTCAAGCTTGGATTGCAAGTATTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAGGAGGACAACTCAAGCACAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAGGAGGACAACTCAAGCACAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.179 | 0.170 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGGAGGACAACTCAAGCACAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.208 | 0.029 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGTGCTTGAGTTGTCCTCCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.209 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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