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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-19 23:28:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 8.
CP093350.1:22755303-22755322
TGTAAGCCGCCCATCCCAAGTAATTAAGAG22755303GATGCGGAAGGTACTGGTCTATGTAATTCGTGGCAACATAGTAAAGGGCA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 8.
CP125308.1:35069091-35069110
TGTAAGCCGCCCATCCCAAGTAATTAAGAG35069091GATGCGGAAGGTACTGGTCTATGTAATTCGTGGCAACATAGTAAAGGGCA
Daucus carota delta12-fatty acid acetylenase gene, partial cds.
AY166774.1:111-130
TGCCCTTTACTATGTTGCCACGAATTACAT111AGACCAGTACCTTCCGCATCCTCTTAATTACTTGGGATGGGCGGCTTACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GATGCGGAAGGTACTGGTCT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GATGCGGAAGGTACTGGTCT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.114 | 0.104 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATGCGGAAGGTACTGGTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.140 | 0.026 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGACCAGTACCTTCCGCATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.141 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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